Похоже, нужно над инициализацией панели ковыряться, т.к. некоторые экземпляры панелей могут так себя вести при подключении к AT91 платам (сброс, возможно неоднокрантый, должен привести ее в чувства), причем, эти же "глючные" экземпляры панелей абсолютно нормально работают, например, на платах с ARM7 (у которых точно такй же инит панели) или iMX233.
То что текущая схема плага не совпадает - временно, я пока не обновил схему.
Из отличий крайней ревизии - добавлены джампера, позволяющие отключать TP стекло от контроллера TP (чтобы можно было непосредственные сигналы TP на разъем увести) и джампер SHUT для возможности управления подсветкой, но это все к плагу SK-WF43BTIBED0-Plug отношения не имеет (у него ни TP, ни внешнего DC/DC подсветки нет).