При установленном демоне watchdog и u-boot с включенным watchdog происходят перезагрузки платы при тех же запусках демок.
В общем, демон не особо помогает, или я не умею его готовить.
Всё же оказалось, что я просто не умею готовить демона watchdog.
Взял другое ядро из десятка, распиханных по всей файловой системе виртуалки, и там нормально было устройство /dev/watchdog
Подшаманил настройки демона, и вроде всё заработало. Теперь плата вроде как не перезагружается.
Осталось только разобраться, как мне собирать ядро из исходников, чтобы устройство /dev/watchdog было в наличии.