я упорствовать не буду, т.б. слабо разбираюсь в данном вопросе по причине ненадобности.
если посмотреть даташит на 9g45, то режим "чистого" jtag действительно определяется состоянием пина JTAGSEL с внутренним pulldn, что при "висящем" выводе я бы трактовал как "соединен с логическим нулем". Т.о однозначно выбирается режим ICE..
кстати, если подсмотреть в схему девборды атмела, там этот вывод заведен через резистор на VDDBU..
ради интереса поставил под виндовс софтину OCD commander
слов ICE ни тут, ни в случае urjtag я не видел, уж как они там договариваются, что видят и что делают - мне неведомо..

Код

>word 0xffffee40
FFFFEE40: A2059B81
>word 0xffffee44
FFFFEE44: 04000000
>cpu
PC: 00000000 SP: 73E7EE58 LINK: 73F12B5C CPSR: 400000D3
CDP p15 15 R15 C15 C10 7

ни аськи, ни скайпа у меня нет, по причине отсутствия технической нужды. есть почта jremizov{ква}mail.ru